TLR3、TLR5和TLR9是Toll样受体（Toll-like receptors, TLRs）家族的三个重要成员，它们在先天免疫系统中扮演着识别病原体相关分子模式（Pathogen-Associated Molecular Patterns, PAMPs）并触发免疫反应的关键角色。

一、TLR3与双链RNA（dsRNA）识别

在感染细胞内病毒产生双链RNA（dsRNA），后者可激活抗病毒防御。因为宿主细胞不产生dsRNA，因此dsRNA也被认为是一种PAMP。TLR3-缺陷小鼠显示对病毒RNA模拟物的反应性下降，提示TLR3参与识别dsRNA。

二、TLR5与鞭毛蛋白识别

大多数杆菌，包括沙门菌含有一种可溶性因子，即鞭毛蛋白，它是鞭毛的单聚体亚单位。鞭毛蛋白能刺激肠上皮细胞内IkB降解、NF-kB激活、IL-8和诱导性NO合酶表达。因此，鞭毛蛋白也被认为是另一种PAMP。TLR5体外表达能赋予CHO细胞对鞭毛蛋白反应，提示鞭毛蛋白通过TLR5发挥其活性作用。

三、TLR9与细菌CpG DNA识别

Tokunaga等1984年首次报道，除细胞壁成分外，细菌DNA也能发挥PAMPs作用。他们发现卡介苗的提取物具有免疫刺激活性，这种免疫活性与DNA作用有关，后来进一步证实，DNA这种活性需要非甲基化脱氧胞嘧啶核苷酸-磷酸盐-脱氧鸟苷酸（deoxycytidylate-phosphate-deoxyguanylate，CpG）结构域，这种结构域很难在脊椎动物的DNA中找到。非甲基化CpG是细菌DNA的特征性序列，又被称为CpG免疫刺激序列。对人和鼠淋巴细胞和抗原提呈细胞均产生免疫刺激活性，引起T_H1产生细胞因子和上调共刺激分子（costimulatory molecules）。业已研究证实，TLR9缺陷小鼠失去对细菌CpG刺激反应，但对LPS、肽聚糖及脂蛋白等刺激的反应与野生型小鼠相同。TLR9选择性表达在浆细胞样（plasmacytoid）树突细胞（DCs），不表达在单核细胞源性DCs，CpG DNA只引起前者细胞产生细胞因子，说明CpG DNA 的反应是依赖于TLR9表达，TLR9是识别细菌CpG DNA的主要受体。TLR介导细菌CpG对巨噬细胞的激活作用亦通过NF-kB途径。

综上所述，TLRs配体的多样性主要与不同TLR分子胞外段（包括胞外段辅助蛋白）的组合方式及PAMP分子结构相关。根据人类基因组测序工作的资料预测，可能会存在25～30种人TLR分子和6种MD辅助蛋白，深化TLRs研究，将更有助于揭示对种类繁多的PAMP分子识别的分子机制。