由于鲎试剂凝集系统中存在着G因子反应旁路，可以被β-葡聚糖激活产生细菌内毒素检查的“假阳性”，通常采用生物方法消除于扰。

USP、EP及JP在最新修订的统一的细菌内毒素检查法中就对鲎试剂的使用作了注释：除内毒素外，鲎试剂也与某些β-葡聚糖反应。一些经过处理而制备的鲎试剂不与β-葡聚糖反应，含有β-葡聚糖的样品必须使用特异性鲎试剂检查。

不同的特异性鲎试剂有不同的特点。

无G因子鲎试剂是将普通鲎试剂中存在的G因子，以亲和层析方法分离去除，即使被测样品中存在真菌多糖（非内毒素），也不能产生活化的G因子，旁路反应被阻断，使成为对内毒素具有特异性。另一种特异性鲎试剂是采用一种特殊试剂，只除去抗LPS因子，而保留抗G因子，以达到即增加了对内毒素的敏感性，又削弱了真菌多糖活性G因子的能力。

此外，1990年Tsuchiya M报道，由于真菌多糖与普通鲎试剂反应形成凝胶，有一个特定浓度范围（10-3~ 10-6 mg/ml），大于或小于这个浓度都不能成胶，故在制备普通鲎试剂的基础上，加入过量的真菌多糖1mg/ml），可阻止G因子的活化，即“封闭”了旁路，达到制备特异鲎试剂的目的。复方丹参注射液、清开灵注射液﹑参麦注射液则是通过加入(1-3)-β-D葡聚糖来消除干扰的。

为了避免β-葡聚糖的干扰，叶良君建议在日常工作中，应尽量用特异性鲎试剂代替普通鲎试剂进行含糖大输液及其他大输液细菌内毒素的检查，如果使用的是普通鲎试剂，应该在排除干扰的情况下结论；同时，应该完善药典中葡萄糖原料的质量标准，β-葡聚糖的含量控制应纳入检测范围，在生产中最好使用定点厂家的合格葡萄糖原料。

应当注意，由于不同厂家生产的鲎试剂其特异性也不同，有时甚至相差很远，因此一旦出现内毒素阳性时，应在排除葡聚糖干扰后再慎下结论以免误判。