细胞表面的IL-6可能是乙型肝炎病毒（HBV）的受体，能介导病毒进入细胞。

多种疾病都可能与IL-6基因调节异常有关，包括炎症、自身免疫性疾病和恶性肿瘤。已知的有IL-6表达异常的疾病状态包括；多克隆B细胞异常、自身免疫性疾病（心脏黏液瘤、类风湿关节炎、酒精性肝硬化、Castleman病、1型糖尿病、甲状腺炎等）慢性增殖性疾病（膜增殖性肾小球肾炎、银屑病、Kaposi肉瘤）、恶性疾病（浆细胞瘤、骨髓瘤、淋巴瘤、白血病、肾细胞癌）、AIDS、脓毒血症、骨质疏松、Fanconni贫血和 HBV感染。

在许多自身免疫性疾病中出现的自身抗体可能与IL-6的高表达有关。在肺结核、类风湿关节炎、溃疡性结肠炎、类肉瘤病、麻风病、Castleman病、Takayasu动脉炎、多发性骨髓瘤等都有半乳糖化的Ig出现，而IL-6转基因小鼠中也有半乳糖化的Ig增加。膜增殖性肾小球肾炎患者的肾小球膜细胞能够产生IL-6，患者尿液中也能够检测出IL-6，而且尿液中IL-6的水平与该病的进程有关，而在其他类型的肾小球肾炎中则无此现象。IL-6能促进角质细胞增生，可能参与银屑病的发病机制。IL-6还可能与B细胞增生性白血病有关，用抗IL-6抗体能抑制患者体内骨髓瘤细胞的生长。但单独的IL-6并不足以引起浆细胞瘤。无论如何，IL-6拮抗剂在临床的运用有很大的潜在价值。