Yang等用血凝素A（haemagglutin A，HA）标记TLR2，发现TLR2被募集到吞噬体内后，对吞噬体内化的成分进行采样，发现只有空间构象相容、化学成分相配才可以发生信号转导效应。热灭活金黄色葡萄球菌和明尼苏达沙门菌（Salmonella minnesota）后，刺激巨噬细胞系RAW624.7细胞，可刺激细胞因子分泌，后来证实热灭活的明尼苏达沙门菌中含有“内毒素蛋白”，并通过TLR2发生作用。人工合成的LPS或纯化的LPS只能够通过TLR4发生作用，TLR4作用的机制可能类似于TLR2。

目前尚无对单体LPS和TLR4分别标记以研究其各自内化途的研究，所以尚有许多问题有待进一步解决，如TLR4与LPS的内化途径是否完全相同，抑或根本不相关，或者两者可能共同内化到相同的位点，然后再分拣到不同的部位等。关于单体LPS内化到高尔基体后，是在高尔基体被修饰失去活性，然后再分拣到溶酶体酶解，还是直接分拣到溶酶体修饰酶解，目前尚无这一方面的资料。但LPS最终是被分拣到溶酶体进行分解代谢，参与三羧酸循环。

一般认为，内毒素内化与解毒存在必然联系，与信号转导无必然相关，一定空间构象的LPS同TLR4发生密切物理接触，促使TLR4的胞质区发生构象变化，足以诱导信号效应。Golenbock等也认为LPS能直接结合TLR4，LPS不需插入细胞膜上及在内化基础上即可以发生信号转导，因为实验证实，C3H/HeJ和C3H/HeN小鼠内化的动力学一样，不存在差异，因此内化与信号转导无必然的联系。抗TLR4的特异性抗体不具有拮抗内毒素的作用，反而具有拟内毒素的活性，所以内毒素内化和激活无关。