饮食成分是影响肠道屏障功能的另一因素。全肠外营养（TNP）可增加肠黏膜通透性和细菌转位，即使使用不同脂质配方的饮食也可增加肠细菌转位。饥饿时可增加细菌转位的发生。有人认为，慢性营养不良一般不会导致肠黏膜屏障功能不全。但此时如再有另外一刺激如炎症或注射内毒素等就可使细菌转位增加。关于TNP及基本要素饮食增加肠黏膜通透性的机制仍不清楚，但近年的研究认为，该机制涉及肠黏膜屏障本身及肠相关免疫功能。Deitch等研究表明，TNP及基本要素饮食可增加上皮对水溶性物质及活菌的通透性。同时也可诱导肠免疫功能及细胞的改变，减少肠上皮内及Peyer结节内的淋巴细胞、IgA⁺浆细胞及IgA的产生等。

正常饮食中的纤维素可能对肠屏障功能的维持具有重要意义。如在饮食中添加纤维素可预防TNP及要素饮食所诱发的肠通透性增加及细菌转位的发生。发泡剂是一种纤维素，也可明显改善肠屏障功能。关于其机制尚不清楚。纤维素可能为常驻菌的食物，在维持肠道微生态平衡中有意义。

谷氨酰氨对肠道屏障功能的维持也很重要。研究认为，肠内或肠外营养中增加谷氨酰氨可减轻肠屏障功能的损害，可改善肠免疫功能。此外，许多肠营养激素和生长激素对肠屏障功能的作用也很重要，主要有胰岛素样生长激素、表皮生长因子、Bombesin，肝素、纤维母细胞生长因子等。也有报道称前列腺素E也可改善肠屏障功能。