（1）脂质A：在过去的数十年里，人们致力于对脂质A的结构和功能的研究，至今由于对脂质A结构的了解，脂质A已可在实验室内人工合成，因此也产生了许多脂质A拮抗剂及脂质A激活剂，但这些人工合成物质的临床意义尚不能完全肯定。

（2）内层及外层核心结构：在各种肠道细菌中，О抗原的结构变化甚大，以致各肠道细菌同种之间的О抗原也不一致，但其核心部位的结构相对保守，变异较小。内层核心结构包括独特的庚糖和2-酮基-3-脱氧辛烷（kedodeoxyoctonate，KDO），而外层核心结构由己糖组成。通过这些糖分子的取代就可产生核心部位结构的差异。这个差异也是大肠杆菌株内或株间变化的原因。在E.coli中已发现5种不同核心结构的菌株类型，即R₁、R₂、R₃、R₄及K₁₂。核心结构的变化主要在外层区域，内层相对保守恒定。来自同种G^-杆菌LPS的核心结构，虽然非常相似，但也不完全一样，E.coli R₃LPS的外层核心部位含有4～6个己糖残基，而E.coli B₄J₅变异株的核心结构仅含一个己糖残基（N-己酰糖胺）。

抗内毒素抗体IgG2a能与克雷伯杆菌所有血清型的LPS起反应，但与别的肠道菌LPS不起反应，甚至包括与克雷伯杆菌密切相关的肠杆菌SPP，这提示尽管克雷伯杆菌的内层核心结构含有与其他G^-杆菌LPS相似的KDO及庚糖，但克雷伯杆菌的核心结构仍具有一定的特异性。

一株铜绿假单胞菌（A₂₈）的完整核心结构日已澄清。其整个核心结构是一个无糖结构，内层由2个KDO和2个庚糖残基所组成，其中在庚糖上有2个磷酸根取代，在另外一个庚糖上有O-氨甲酰基（carbamoyl）取代。在外层核心结构D-半乳酸糖胺的C₂位置上有赖氨酸残基取代。

能识别铜绿假单胞菌内层、外层核心结构及脂质A结构的单克隆抗体同样能识别具有完整核心结构或核心结构完全缺乏的LPS，因此可认为，LPS的内层核心结构较外层结构更保守，这已在许多实验中得到证实。第三组抗体Mab7-4是内层核心结构特异性抗体，能与各种铜绿假单胞菌的LPS起反应，但不能与其他肠道细菌的LPS起反应。另一抗体Mab177不仅能与铜绿假单胞菌的LPS起反应，而且还能与其他肠道细菌的LPS起反应，这种抗体是脂质A特异性的，而不是核心糖链特异性的。

这些研究表明，肠道细菌与铜绿假单胞菌LPS的核心结构具有共同的抗原决定簇，但同样又具有种特异性抗原。

（3）О侧链：由不同的多糖结构组成，变异很大。与脂质A及核心结构抗体不同，О侧链抗体只能中和同血清型的LPS，对其他同种不同血清型的LPS无效，因此这种抗体的临床价值不大。