一、脾脏

脾内含有全身15%定居组织内的巨噬细胞，而巨噬细胞是重要的内毒素清除细胞。

内毒素经静脉注入后，除在肝脏聚集外，大量内毒素也能在脾脏内迅速聚集并被摄入巨噬细胞内，因此脾脏同样是重要的内毒素清除器官。其清除作用除表现在其直接作用外，更重要的是脾内的巨噬细胞是肝库普弗细胞的前体细胞，对肝脏的内毒素清除具有非常大的影响。有研究发现，在脾切除术后肝内巨噬细胞、库普弗细胞数量较对照组明显减少，而且脾切除术可以减轻由内毒素徼活库普弗细胞释放炎症介质引起的肝细胞损伤，说明眸切除术减轻肝损伤可能与向肝内浸润、并转化为库普弗细胞的脾巨噬细胞数目减少有关。

二、肠

肠道清除内毒素机制与肠绒毛顶端的上皮细胞有关。

通常情况下，向肠道内注入内毒素，肠腔内的内毒素并不进入肠上皮细胞，但经静脉注入内毒素后，内毒素可能进入肠上皮细胞内。内毒素可能通过内毒素识别受体的方式和（或）简单扩散的方式进入肠上皮细胞。

有实验发现，静脉注入内毒素后1h，肠固有层巨噬细胞内即出现内毒素；注射后8h，内毒素可以出现在肠绒毛端的上皮细胞内。静脉内的内毒素进入肠上皮细胞的途径可能有两条：①从固有层巨噬细胞中移位至肠上皮细胞基底侧，并从该侧进入肠上皮细胞；②在内毒素作用下，肠固有层巨噬细胞、肠上皮细胞释值大量NO及氧自由基，造成肠固有层微血管损伤，通透性增加，内毒素渗出血管外并最终移位至肠上皮细胞内。

肠绒毛顶端的上皮细胞具有更强的亲和、摄取内毒素的能力，因而内毒素可以从隐窝开始，沿着肠绒毛移动，最终到达绒毛顶端的肠上皮细胞内。摄取了内毒素的绒毛顶端上皮细胞脱落，同时将内毒素带入肠腔，从面构成了内毒素的有效清除机制之一。